全世界の科学者が自らの最新型ロボットを発表するイベント「世界ロボット博覧会」。そこに突然現れたワイリーは、数々のロボットを暴走させ、またも世界征服の野望に乗り出した。平和を守るため、そしてワイリーの野望を阻止するため、ロックマンは再び立ち上がった。
| ボス名 | 弱点武器 | 入手武器 |
| トードマン | リングブーメラン | レインフラッシュ |
| ブライトマン | レインフラッシュ | フラッシュストッパー |
| ファラオマン | フラッシュストッパー | ファラオショット |
| リングマン | ファラオショット | リングブーメラン |
| ストーンマン | ナパームボム | パワーストーン |
| チャージマン | パワーストーン | チャージキック |
| クリスタルマン | チャージキック | クリスタルアイ |
| ナパームマン | クリスタルアイ | ナパームボム |
| バラード | バラードクラッカー | |
| ワイリーマシンワールド4号(第一形態) | ||
| ワイリーマシンワールド4号(第二形態) | バラードクラッカー | |
| ワイリーカプセル |
ファラオショット バラードクラッカー |
