インストールが終了したら起動してみましょう。
ログイン画面が表示されるのでログイン情報を入力してください。
ログインすると毎日ログインボーナスが貰えます。
ボーナスはトークン（ゲーム内通貨）だったりブースターパックだったり、テーマデッキだったりします。
OKを押して次へ行きましょう。
2013/8現在のホーム画面です。
まずはSinglePlayerモードで遊んでみることをオススメします。
上の画面は初期アカウントのホーム画面です。各機能の詳細は別ページで解説します。
ゲームを進めていくと解禁される機能があります。（下記画像）
※Tournament機能は2013/8現在未実装になっています。
下記から各画面の説明です、類似する機能は説明を省略しています。
SinglePlayerモード
主にNPC対戦で遊べます。
初めてプレイする場合このゲームモードで慣れておくといいでしょう。
QuickGameは初めて構築したデッキを回してみたい時にも重宝します。(NPCのプレイは早いのでサクサク回せます)
Multplayerモード
プレイヤー同士のネット対戦ができます。
フォーマットは主にModifiedとUnlimitedがあります。
Modified:日本でいうスタンダードフォーマットです。2013/8現在BW1〜BW8相当まで使用できます。
Unlimited:無制限フォーマットです。といってもPTCGOではLEGEND〜BWまでしか無いため、いわゆる殿堂フォーマットとは別物になります。
DeckManagerはデッキ構築を行ったり、管理することができます。
Cardモード
Tradingはプレイヤー同士のカードトレードを行えるモードです。
Collectionは所持しているカード、パック、アバターのパーツ等の確認ができます。
shopはトークンとパックを交換したり、コードカードのバーコードを読み取りパックに交換したりできます。
また、ホーム画面の他に以下の様な画面があります。
この画面は各機能を使用したあとに表示されたりします。
ホーム画面よりこの画面の方が使用頻度が高いです。この画面の機能だけ覚えておけば問題ないでしょう。
①Play：SinglePlayerやMultiplayerの総合です。
②Profile：ユーザの過去の戦績やAchievements（PS3のトロフィーやXBOXの実績の様なもの）が閲覧できます。
③Avatar：ユーザのアバター（キャラクター）を変更します。
④Collection
⑤DeckManager
⑥Trade
⑦Shop
⑧メッセージ：トレードの結果等が通知されます。
⑨Friends:フレンドのログイン状態を確認したり、フレンドの申請、承諾、拒否、ブロック等ができます。
⑩Options:ゲームの設定ができます。
⑪Help:ヘルプ画面をブラウザで開きます。
⑫Tokens：ゲーム内通貨トークンの所持数
⑬Gems：これもゲーム内通貨ですが、リアルマネーで買うことでしか手に入りません。(２０１３/8現在カナダドルで試験的に購入できるのみ)
⑭Pack所持数：以前の仕様では使っていましたが、現在は殆ど使用しません。
⑮Tournamentkeyｓ：2013/8トーナメント未実装なので使用しません。
⑯ゲーム終了ボタン
